南京财经大学工会是校党委领导、江苏省教育科技工会指导下的教职工群众组织，现有会员1800多人，29个分工会，6名专职工会工作人员，120多名兼职工会干部。现有工会委员会委员19人，设主席1人，副主席1人。下设经费审查委员会、女工工作委员会、福利工作委员会、文体工作委员会、青年工作委员会等专门工作机构。
南京财经大学工会活动场所总面积约1800平方米，包括阅览室、棋牌室、乒乓球室、健身房、卡拉OK厅等，为教职工开展多种文体活动创造了良好条件。
南京财经大学工会在校党委和上级工会的领导下，坚决贯彻落实党的教育方针，以“围绕中心、服务大局、推动发展、促进和谐”为指导思想，以“全心全意为教职工服务”为根本宗旨，全面履行工会“维护、建设、参与和教育”四项基本职能，充分发挥工会组织的桥梁纽带作用，与时俱进，注重创新，着眼发展，在工会自身建设、参与学校民主管理、坚持和完善教代会制度、为教职工办实事、丰富教职工文化生活、推进和谐校园建设等方面做了大量富有成效的工作，为学校的改革发展稳定做出了积极贡献。近年来，南京财经大学工会先后被江苏省教育科技工会授予“先进教工之家”、“高校工会工作先进集体”、“模范职工之家”称号，2013年被江苏省总工会授予“模范教工之家”称号。2019年学校被江苏省总工会授予“五一劳动奖状”。
